会议背景

  当前的大数据时代对生物医学领域产生了巨大的影响，成为生物医学领域的最新驱动力。各种生物医学数据库应运而生，使得数据分析及数据挖掘在生物医学领域的应用具有重要的意义。其中癌症基因图谱The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据,从而为发现影响肿瘤起始、发展、分化、转移等生物学机制提供了海量数据基础。

  Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) 是美国权威的癌症统计数据库，该数据库记录了美国部分州县上百万名恶性肿瘤患者的发病率、死亡率和患病情况等信息。SEER数据库旨在降低美国人口的癌症负担，数据库中肿瘤信息通过SEERStat软件进行统一和规范，并定期更新发布。全球肿瘤研究者均通过申请获取部分数据，这为缺少临床科研数据的临床研究者提供了很好的数据来源。此外，SEER数据库样本量大，统计学效能强，这使基于SEER数据库的研究具有较高的临床参考价值。

  临床医生可以从数据库里免费下载与自己研究方向相似的数据来进行分析，并撰写论文。通过将数据挖掘方法、生物信息学和医学统计学进行融合，挖掘公共数据库并提取有价值的信息，能够为研究者更深入的进行研究提供帮助。

培训特色

1. 针对相关软件进行实操教学，掌握各类数据挖掘方法的实现；

2. 实操配合案例解析，完整解读各类数据挖掘方法的运用及结果分析；     

3. 深入讲解重点生物医学数据库的使用方法，结合数据库的在线工具和R语言编程分析各种类型数据；

4. 详细讲解公共数据库数据挖掘的研究策略，结合讲者的相关发文经验分享数据挖掘文章撰写的基本套路。

培训对象

l 从事医学、生命科学等相关专业的科研人员；

l 对生物医学数据挖掘及分析的具体方法有学习需求的医护人员、医学生、药企科研人员；

l 临床忙、没时间做实验或研究条件有限，希望将临床大数据应用与临床研究中并对SCI论文发表有迫切需求的医学生、临床医生及科研工作者。

培训日程

9月21日

8:30-9:30     数据挖掘介绍

              数据挖掘简介

              数据的来源（可利用的数据、不同数据的异同点、不同数据的挖掘方法）

9:31-10:30    临床研究中生信数据应用实例分析与研究思路

              公共数据库在临床科研应用中的应用思路

              生信技术在临床研究中的应用思路及文献实例解析

10:45-12:45   R语言基础实操（上）

              数据分析处理

14:00-15:00   R语言基础实操（下）

              常用图表的制作

15:15-18:15   公共数据库数据检索、下载与分析处理

              TCGA数据库的功能介绍及实操

              GEO数据库的功能介绍及实操

              其他相关数据库的功能介绍及实操

9月22日

8;30-11:30    生物医学组学数据挖掘

              聚类分析（概念、常用聚类方法及R软件实现与可视化）

分类分析（决策树与随机森林原理、构建及结果的可视化等）

主成分分析（概念，应用及案例解析）

Logistic回归分析与生存分析（列线图及校准图绘制）

基因R的CancerSubtypes软件包的肿瘤亚型分析

10:45-12:45   基于数据挖掘的疾病关键调节分子（上）

              基于数据挖掘寻找关键疾病调控分子

              网络拓扑性质简介、分子网络数据库介绍

              案例讲解：应用网络拓扑性质识别疾病关键调控分子

14:00-15:00   基于数据挖掘的疾病关键调节分子的探索（下）

              构建网络及可视化（Cytoscape）

              Cytoscape软件介绍、Cytoscape插件简介

15:01-16:00   临床样本检测验证、后续结果分析与论文组装

              解读生物数据与临床数据的整合分析思路

              基于GEO与TCGA公共数据库挖掘的SCI论文写作与发表

肿瘤基因表达与免疫浸润的最新研究热点

本期大咖 

廖奇 副教授 宁波大学医学院

曾作为访问学者在哈佛大学丹娜法伯癌症研究中心进修

研究方向：非编码RNAs的生物信息学分析

研究成果：以第一作者或通讯作者身份在国际著名SCI期刊《Nucleic Acids Res》 (IF=10.162)等发表多篇论文。2010年，首次提出基因芯片中可检测长非编码RNA表达谱的设想，利用GEO数据库中重注释的基因芯片数据，构建长非编码RNA与蛋白编码基因的双色共表达网络，对长非编码RNA的功能进行大规模的预测，该工作目前已被引用超过200次，为长非编码RNA的功能注释领域开创了新的方法。主持多项国家自然科学基金、省自然科学基金、市自然科学基金，参编教材4部。目前同时担任浙江省生物信息学学会副秘书长，浙江省预防医学会卫生统计学专业和寄生虫专业委员会委员。

华琳 副教授 首都医科大学生物医学工程学院

研究方向：生物统计与生物信息学。

研究成果：主讲《医学统计学》、《医用数据挖掘》、《医药数理统计方法》、《临床及分子生物学大数据处理》和《生物信息学技术概论》等课程。擅长统计研究设计、各类型数据统计分析、生物医学大数据挖掘及生物信息学分析等，近5年内在相关领域以第一作者和通讯作者发表论文30余篇，其中SCI论文近20篇。主持和参与多项国家级、省部级和局级科研课题，与北京多家临床医院开展了数据分析方面的合作，并建立了良好的合作关系，目前是首都医科大学中青年骨干教师和北京市中青年骨干教师。

会议主办单位

南京医格尔信息科技有限公司

会议承办单位

医盟V课堂平台

南京采卓生物科技有限公司

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 报名价格

注册费含会场、专家讲课费、教材、午餐、税费。不含住宿费、交通差旅费！

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